En instancia de finales solamente fue derrotado una vez en la Supercopa Sudamericana y dos por la Recopa Sudamericana. Por segunda vez se consagra campeón en el Maracaná frente al Flamengo pero esta vez en la Copa Sudamericana 2017, siendo el único hasta la fecha en dar la vuelta olímpica en dicho estadio en dos oportunidades. Raúl terminó el torneo con 17 partidos, atletico de madrid camiseta y 8 goles anotados y surgieron rumores que indicaban que Raúl podría pasar a un equipo europeo después de la Copa del Mundo.
